真名为方是民，笔名为方舟子，1967年9月出生于福建省漳州市云霄县，高考时成为福建漳州市云霄县的县理科状元，成功考入中科大。1990年中国科技大学生物系细胞生物学专业本科毕业，同年赴美留学。1995年获美国密歇根州立大学生物化学博士学位，先后在罗切斯特大学生物系、索尔克生物研究院做博士后研究，研究方向为分子遗传学。目前定居美国加利福尼亚州，从事互联网开发、写作和兼任生物信息公司的咨询科学家。为中文互联网的先驱者之一。1994年创办世界上第一份中文网络文学刊物《新语丝》，主持新语丝网站（www.xys2.org），担任新语丝社社长。2000年创办中文网上第一个学术打假网站“立此存照”(www.xys2.org/pages/dajia.html)，揭露了多起科学界、新闻界等学术腐败现象。

自1999年以来，方舟子设立新语丝网站，通过发表自己的文章以及刊登网友文章，揭发中国科学界和教育界的学术腐败现象，批判新闻界的不真实报道，以及批判基督教、伪科学、伪气功、伪环保，批评中医等。方舟子同时是许多知名平面媒体的专栏作家，并且出版过一些以科普和反学术腐败等为题材的著作。由于在评判时过于犀利，方是民本人和他的言论在社会上引起极大争议。